Darüber hinaus ist das Bundesaufsichtsamt nach dem Wertpapier-Verkaufsprospektgesetz Hinterlegungsstelle für die Wertpapierverkaufsprospekte. Zur Erfüllung seiner Aufgaben arbeitet das BAWe mit anderen Bundesbehörden eng zusammen, beispielsweise mit dem Bundesaufsichtsamt für das Kreditwesen. Ebenso wichtig ist die internationale Zusammenarbeit bei der Beaufsichtigung des Wertpapierhandels.